Instale o gerenciador de inicialização 'grub' no disco rígido externo (google para detalhes). Em seguida, você pode criar um menu que aparece no momento da inicialização e oferece opções para inicializar a partir de diferentes discos / partições.
Alternativamente, quando você instala uma distribuição Linux em uma partição, ela (na maioria das distribuições) lhe dará a opção de instalar o bootloader grub2, que verifica todos os sistemas operacionais no computador e cria um menu de inicialização. >