Consulte esta discussão nos fóruns da Apple para obter informações adicionais: Não, um recurso de backup não deve ser usado para Sincronizando arquivos e, como tal, tentar usar backups dessa maneira será problemático, possivelmente corrompendo a integridade do sistema.
Em vez disso, use um aplicativo criado para isso. Além dos mencionados no artigo mencionado, há vários disponíveis na App Store encontrados por meio da pesquisa "sincronização de arquivos".