Não, o root em sistemas Unix sempre recebe acesso total; controle de acesso regular simplesmente não se aplica. Você não pode impedir que o root exclua um arquivo. Mesmo se você pudesse, o root ainda seria capaz de mudar para qualquer outra conta, incluindo aquele que pode excluí-lo. (Sistemas de controle de acesso obrigatórios como TrustedBSD podem ser capazes de restringir a raiz, mas eu não acho que o OS X tenha isso.)
(posso estar errado)