Infelizmente, você não pode adicionar essa opção ao menu, porque é uma lista codificada de opções. Você teria que escrever um script executado em segundo plano que detecta a tampa sendo fechada e ativa o desligamento automaticamente.
O comando que você precisa (para verificar se a tampa está fechada é):
cat /proc/acpi/button/lid/LID0/state
Agora, não sou um viciado em script (quero dizer, script bash), então talvez alguém possa editar isso e dar a você uma resposta adequada.