O 'filetype' é apenas uma descrição 'prática' do tipo de arquivo / pasta que está na exibição. Às vezes, o final do arquivo ou da pasta é '.whatever' e ele simplesmente diz que é um arquivo 'WHAVERVER' (independentemente de ser uma pasta). Isso pode ser considerado um erro na GUI por não detectar que o 'tipo de arquivo' não deveria se aplicar logicamente a nenhuma pasta, mas é essencialmente o que está acontecendo.
tldr: não afetará nenhum dos seus arquivos / sites.
Se isso pode te incomodar muito, deixe-nos saber qual GUI (Gnome, KDE, Fluxbox, etc.) você está usando e pode haver uma maneira de 'corrigi-lo' através de algum arquivo de configuração.