Se você tiver muitos arquivos, pode ser que o Windows esteja lutando para mantê-lo, por assim dizer. Acontece comigo quando abro certas pastas que são preenchidas com arquivos executáveis. Os arquivos têm ícones genéricos, depois de alguns minutos (minutos), funciona bem.
Você precisa reiniciar o Explorer ou ele se conserta depois de um tempo? Se este último, você pode excluir a pasta como Peter Maxwell diz ou ocultar alguns dos arquivos maiores.