O SVN 1.6 e o 1.8 têm formatos de cópia de trabalho completamente diferentes e o 1.6 não entende o formato 1.8. Como resultado, o TortoiseSVN simplesmente ignorará suas pastas de checkout existentes.
Para poder verificar os ficheiros necessitará de verificar os ficheiros utilizando o TortoiseSVN 1.6, deverá então poder modificar e verificar novamente os ficheiros.