Se você estiver usando um Gráfico de Dispersão, os pontos de cada série devem ser localizados com base nas coordenadas X e Y de cada ponto. Desde que sejam precisos e o eixo do gráfico esteja formatado para mostrar todo o intervalo de dados, ele deve localizar automaticamente todos os pontos de ambas as séries corretamente. Se você precisar de uma amostra, poste seus dados e podemos usá-los para gerar um.
EDITAR: Usando seus dados, aqui está o gráfico que criei. Para a primeira série (16 valores), use os valores 1-16 para o eixo X. Para criar uma segunda série uniformemente espaçada, divida os 16 valores em 12 e use esses valores para o eixo X. Seu resultado final será parecido com isto:
Se você precisar de um espaçamento / distribuição diferente para sua segunda série, será necessário conectar números diferentes em seu eixo X.