Não, eles não serão RAIDed automaticamente. Após inserir dois discos, você precisará entrar no controlador IntelRST após o BIOS (acho que é Ctrl + I na maioria dos sistemas) e criar uma nova unidade RAID deles . Controladores RAID geralmente detectam discos pelo seu número de série, então tudo tem que ser especificamente configurado.
As únicas vezes em que você estará fazendo hot-swap serão se uma unidade falhar ou se você pretende destruir a matriz RAID. Se uma unidade falhar e você tiver redundância (RAID1 ou RAID5, que com duas unidades, a única possível é a RAID1), será necessário remover a unidade defeituosa, colocar uma nova com tamanho igual ou maior e, em seguida, abra o painel de controle IntelRST e adicione a nova unidade como um hot spare ao conjunto RAID. Os drivers cuidarão de reconstruir o array a partir daí.
Se você estiver executando o RAID0 e uma unidade falhar, você estará sem sorte. Substitua a unidade defeituosa, adicione-a à matriz e formate a matriz.