Você pode aplicar as mesmas diretivas que você usa em .htaccess
arquivos em seu httpd.conf, você só precisa colocá-los na seção <Directory>
, provavelmente aquela que lida com sua webroot.
Se você quiser usar um arquivo .htaccess
em um diretório específico, use AllowOverride AuthConfig
em todos os lugares (para poder adicionar usuários por diretório / site, se preferir) ou especificamente para esse diretório em seu httpd.conf.