Você está usando a versão 2.0 ou a versão 3.0 do php_sqlsrv_53_nts.dll?
Você tem aspas em torno do seu diretório de extensão? por exemplo:
extension_dir="C:\Program Files\PHP\ext"
Para a versão 3.0 do driver, você precisa:
A 32-bit version of PHP
A web server (e.g. IIS or Apache) configured to launch PHP using FastCGI.
ODBC driver "SQL Server Native Client 11.0" ( SQL Server 2012 Native Client )
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ou * para a versão 2.0 do driver, você precisa:
Uma versão de 32 bits do PHP Um servidor da Web (por exemplo, IIS ou Apache) configurado para iniciar o PHP usando o FastCGI. Driver ODBC "SQL Server Native Client 10.0" (cliente nativo do SQL Server 2008)
Para obter mais ajuda, você pode dar uma olhada aqui