Eu encontrei uma maneira de fazer isso com o AutoHotkey:
Etapa 1: faça o download do autohotkey.exe
Passo 2: Instalar > autohotkey.exe
Passo 3: Escreva este script e chame-o (stop.ahk):
SetTitleMatchMode, 2 ; mode 2 = title only needs to contain string to match
SetKeyDelay, 0 ; set key delay to minimal
#WinActivateForce ; automatically use more forceful methods
IfWinExist, run-minecraft ; check if there is a cmd window with this title
{ ; send the commands
ControlSend, ,say Server will shutdown in 10 seconds, run-minecraft
ControlSend, ,{enter}
sleep, 9999
ControlSend, ,stop, run-minecraft
ControlSend, ,{Enter}, run-minecraft
return
}
Passo 4: Coloque title run-minecraft
na frente do seu start.bat
Passo 5: Clique esquerdo (stop.ahk) e selecione o script de compilação
Etapa 6: execute o aplicativo com o gerenciador de tarefas do Windows