As opções incluem configurar as unidades de destino como um único volume (RAID, LVM, btrfs ...) ou executar dois comandos rsync em subconjuntos dos dados na unidade de 3TB.
A primeira opção torna o trabalho simples (há apenas um destino), mas tem a desvantagem de que ambas as unidades devem estar conectadas para acessar os dados.
O último é um pouco mais de esforço, pois é necessário identificar um conjunto de pastas que seja menor ou igual a 2 TB em tamanho, mas que permita o acesso aos dados em cada unidade de destino de forma independente. A melhor maneira de construir os comandos rsync, se o conjunto de pastas é mais complexo do que alguns na raiz da unidade de 3TB, é provavelmente usar a opção --exclude-from
do rsync.