wget já é fornecido pelo Ubuntu. Você não precisa instalá-lo externamente.
Para responder à sua pergunta, se você ler as instruções de instalação, verá que pode chamar o script de configuração da seguinte forma:
./configure --help
O prefixo de instalação é determinado pela opção --prefix . O padrão é:
--prefix /usr/local
Se você quiser instalá-lo no / usr, você faria:
./configure --prefix /usr
O que não é recomendado, já que somente pacotes fornecidos pelo Ubuntu devem ir para lá. / usr / local é para coisas que você instala fora do gerenciador de pacotes. Se você instalar o wget do repositório do Ubuntu, por exemplo, ele será instalado em / usr.