Não há diferença de desempenho. SATA e eSATA são o mesmo protocolo e são igualmente rápidos.
As únicas diferenças são:
- Conector diferente. (Sturdier).
- Tensões levemente mais altas no cabo eSATA. (400 a 600 mV no SATA, 500 a 600 mV no eSATA)
- Comprimentos de cabo mais longos são permitidos para o eSATA. (Comprimento máximo para SATA é 1 metro, eSATA dobra isso)