Se você estiver usando o Ubuntu 10.10 ou 11.04, a área de notificação foi desativada por padrão. Isso foi feito para favorecer os indicadores do Ubuntu. Há um tutorial mostrando como ativar a área de notificação novamente em WebUpd8.org .
No entanto, se você usar o Ubuntu 11.10 ou superior, existe um novo recurso capaz de converter muitos dos ícones de notificação em indicadores simples. Isso é automático. Então iBus no Ubuntu 11.10 aparece normalmente na barra superior da sua área de trabalho.