Tente restaurar o cabeçalho do volume no menu Ferramentas (talvez seja necessário mover a unidade para outro sistema que tenha o Truecrypt instalado). O Truecrypt armazena um cabeçalho de backup no final do volume.
Claro que, depois de ter o seu cabeçalho de volume restaurado, o Truecrypt pode montá-lo, mas o Windows não. Agora você terá o problema separado de tentar reconstruir um sistema de arquivos com os primeiros ~ 100MB sobrescritos. É provável que você precise de utilitários de recuperação (o Recuva do Piriform é um deles) para extrair arquivos dele.