A causa mais provável disso é que o sistema de arquivos FAT foi corrompido devido a perda de energia ou algum outro problema que impediu que uma operação de arquivo fosse concluída com êxito.
O mesmo que tirar uma unidade USB de um PC sem removê-la com segurança.
Pode ser reparado usando
/sbin/fsck.vfat -a /dev/<fat device>