Não tenho tanta certeza sobre "setores", mas ntfsresize de ntfs-3g permite redimensione os sistemas de arquivos NTFS para a precisão do kibibyte, que geralmente corresponde a dois "setores". A maioria das ferramentas de partição * NIX, incluindo fdisk , parted e cfdisk , permite redimensionar a partição em incrementos de 512 bytes, correspondendo a um "setor".
Todos, ou um subconjunto, dos acima estão disponíveis na maioria dos live discos do Linux, eu prefiro os discos live do Gentoo, disponíveis aqui .
Verifique as man pages correspondentes para obter instruções para os programas individuais.
PS: Aparentemente, o software nativo de particionamento de janelas ( diskpart ) só permite a precisão do MiB.