A reinstalação do OS X não deve afetar a partição do Windows 7, pois, uma vez instalada, a partição do Windows 7 não depende mais do bootcamp (todos os bootcamps colocam muitos drivers e não na partição). Você deve ser capaz de inicializar a partição do bootcamp como de costume.
Nota: se você não conseguir inicializar o Windows 7, algo deu errado, e isso exigiria mais detalhes.