Bem, se você tem uma conta do Google, pode configurar agendas com tarefas recorrentes que permitem que você verifique as coisas ao fazê-las.
Há também listas de tarefas mais simples, como TuexDuex, que move automaticamente as tarefas inacabadas para o dia seguinte ou algo como Remember the Milk.
Depois, há os antigos standbys usando o Microsoft Office com pop-up que você pode descartar à medida que faz isso ou o Thunderbird no lado do código-fonte aberto.
Se você está gerenciando o tempo para o minuto eu sugiro algum tipo de software de Gantt que bloqueia segmentos de tempo.