O BIOS não tinha nenhum recurso de economia de energia ativado, e eu não consegui encontrar nenhum que estivesse habilitado no meu sistema de servidor Ubuntu (bem, exceto desligar o monitor depois de tanta inatividade, é claro). Eu nunca encontrei uma resposta direta para essa pergunta, mas está me incomodando em aceitar uma resposta aqui, então aqui está o que eu fiz para resolver a situação:
Eu escrevi o processo de montagem do & descriptografar o disco rígido, executando a rotina de backup e, em seguida, desmontando a unidade novamente. Como um efeito colateral conveniente, fica mais fácil pegar o disco e removê-lo para levá-lo para um local externo.