Eu recomendo que você use o Windows PowerShell. Faz parte do sistema operacional desde o Windows Vista e Windows 7 (também pode ser instalado no Windows XP). O PowerShell é um ambiente de script orientado a objetos realmente poderoso, baseado no .NET Framework, para o sistema operacional Windows (semelhante ao Linux Bash). Há muita documentação disponível da Microsoft em como usar o PowerShell .
Também há um bom livro PowerShell disponível aqui .