Isso não pode ser (totalmente) resolvido. Wubi significa que você executa o Linux em "NTFS", não é apenas para uso em desktop. O Wubi está lá para pessoas que querem experimentar o Linux / Ubuntu.
A velocidade de navegação, eu acho, será o cache. Aqui é um artigo como acelerar isso. Vai usar mais memória, mas vai renderizar mais rápido.
No entanto ... e eu sou realmente honesta aqui, em páginas do Windows são renderizadas muito mais rápido FOR ME (observe a parte do FOR ME!). Eu tentei muitas distribuições e ainda usando Linux em alguns dos meus PCs, mas não. Você poderia dizer que é tudo sobre o openGL e outras coisas que virão com o Firefox 4 .. mas não. Sempre foi mais rápido.
Além disso, falamos sobre o renderizador do seu navegador aqui. E quanto ao seu driver de rede? Esse é o outro suspeito. Driver de vídeo? Qual VGA você tem?