Como Zurahn mencionou, o finalbootcd é um utilitário gratuito muito bom. Não para obter off-topic, mas você já pensou em usar o VirtualBox ou VMWorkstation para evitar dores de cabeça dual-boot / particionamento? Você não especificou exatamente por que você teve que usar o dual boot. Hoje virtualizo quando posso evitar complexidades de inicialização dupla / tripla. Você pode recuperar o espaço em disco que particionou para Linux e tudo o que você realmente acabará usando é mais CPU / RAM, mas atualmente eles não são muito caros. Apenas meus dois centavos.