O Gmail tem uma ótima capacidade de verificar suas contas pop e enviar e-mails por meio de suas próprias configurações de SMTP. No entanto, ele sempre mostrará algo como "de: [email protected] as [email protected]" no cabeçalho de alguns clientes de email mais avançados (como o Outlook).
Se você conseguir configurar seu próprio servidor de e-mail, vá em frente, mas será difícil e caro obter o mesmo tempo de atividade e qualidade de serviço que o Gmail. Se você tiver seu próprio domínio, recomendo o uso do serviço do Google Apps para que você tenha a qualidade do Gmail, mas com seu próprio endereço de e-mail.