Eu entendo que o Win7 não está instalado no disco de inicialização.
Não é tão fácil alterar todas as referências a um disco rígido. Estes são encontrados no registro, e você pode entrar em apuros com isso. O bcdedit não ajuda aqui.
A melhor aposta é, depois de copiar A- > B, simplesmente conectar B ao invés de A.
Então, nenhuma alteração é necessária.