Se houvesse realmente 26 vírus, depois de uma infestação tão grande, não seria raro reformatar o disco rígido e reinstalar o Windows.
Antivírus não são perfeitos e, às vezes, destroem parte do Windows durante a limpeza. HiJackThis é especialmente perigoso, porque a maioria do que mostra é legítimo, então, na verdade, você pode ter apagado o software necessário para executar o computador. O mesmo vale para o CCleaner de uma maneira menor.
Se um CD de restauração vier com sua máquina, você poderá revertê-lo para o estado em que foi comprado. Salve primeiro todos os dados que precisam ser salvos. Se você não tiver um CD de restauração, há outros tópicos que lidam com essa situação.