Ok, fizemos algumas pesquisas e descobrimos que isso ajudou:
- Em vez de 'localhost', use o endereço IP. Por exemplo:
app.config['MYSQL_HOST'] = '127.0.0.1'
aparentemente, os clientes possuem algum aliasing interno que resulta em conflitos. Leia: fonte - Adicione a configuração de configuração do Flask
app.config['MYSQL_UNIX_SOCKET'] = 'TCP'
, que especifica que a conexão é remota.