Conforme documentado aqui e em outros lugares, o subsistema do Windows para Linux está atualmente em beta e, portanto, não está disponível no Branch de Serviços de Longo Prazo do Windows 10. Minha experiência no LTSB é que você pode ativar o recurso WSL, mas o Windows Store não faria o download do distro appx.
Alguns dias atrás, notei um início do MS:
"Existem vários cenários em que você pode não (ou não) querer instalar distros do WSL Linux através da Windows Store. Especificamente, você pode estar executando
O SKU do OS de desktop do Windows Server ou do Long-Term Servicing (LTSB / LTSC) que não suporta o Windows Store ou as políticas de rede corporativa e / ou os administradores não permitem o uso da Windows Store em seu ambiente.
Nestes casos, enquanto a própria WSL está disponível, como você faz o download e instala distros do Linux no WSL se você não consegue acessar a loja? "
link
Isso me levou a pensar que a WSL estaria disponível no LTSB. No entanto, encontro o mesmo erro de "versão não suportada" quando tento instalar o pacote. Também o MS howto doc parece um pouco apressado (links ruins, erros de gramática / ortografia), então eu não sei quanto estoque colocar nele.