De acordo com a documentação aqui , o seguinte deve funcionar:
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Classes\avi_auto_file\shell\RemuxvideotoMKV\command]
@="cmd /C start \"remux\" /MIN \"C:\Program Files\MKVToolNix\Remux video to MKV.bat\" \"%1\""
start
inicia um lote ou programa, a opção /MIN
inicia o programa minimizado. Há também um /B
para ser executado sem criar uma nova janela.
Como @JosefZ apontou porque start
é parte do shell cmd (entradas pontilhadas nesse link) precisa ser executado a partir de cmd
.