Relacionado a esta recente pergunta: Um vírus do Windows pode ser transferido para o Ubuntu? e o comentário da JFA, que não é apenas interessante, mas também válido:
Can you also get a Windows virus by running an infected .exe in Wine?
Eu estava me perguntando o mesmo. Além disso, quão grande é a possibilidade de danos potenciais, devido à execução de código malicioso dentro do executável, durante a execução no Wine? (Eu acho que a maioria dos usuários de Linux que também usam vinho e similares não usam proteção antivírus, mas ainda se deparam com esse problema, sem serem notados.)
Isso não aborda o escopo completo, mas pode ser útil ter em mente.
O software antivírus é útil para analisar arquivos. Por exemplo, sob o GNU / Linux você pode usar a execução anterior do arquivo executável.
Para esta tarefa, existem vários sites que analisam arquivos locais e online, e um dos softwares de desktop mais populares é o ClamAV .