Sim, é possível criar um live usb com o sistema de arquivos NTFS para instalar o Ubuntu, de acordo com este artigo na Documentação do Ubuntu , você também pode usar um sistema de arquivos FAT32 / FAT 16.
Certifique-se de ler atentamente o artigo e seguir as instruções passo-a-passo, porque tentei o mesmo com o USB Stick (com o sistema de arquivos NTFS) e funcionou corretamente.