Pelo que entendi melhor, você deseja fazer o backup de uma unidade externa para outra unidade externa, de preferência usando algum tipo de utilitário para automatizá-la.
O Time Machine é ótimo para fazer backup de um MacBook ou iMac, e você pode até configurá-lo para alternar entre vários discos para redundância, mas o Time Machine não é capaz de gerenciar vários backups distintos separados por conta própria. Ele é projetado para fazer backup do sistema - e, opcionalmente, de quaisquer unidades externas formatadas como HFS + ou APFS - em suas unidades de backup. Não é possível fazer o backup da unidade A para a unidade B e, ao mesmo tempo, fazer o backup da unidade C para a unidade D. (Pelo menos não sem um pouco de fanangling cada vez que você deseja mudar o foco.)
Quanto a clonar o drive via Disk Utility, ele depende do tipo de drive que você está clonando para . Se você estiver usando uma unidade de disco rígido (com um prato magnético), não deve haver nenhum desgaste incomum. Se você estiver usando uma unidade de estado sólido, ela gastará as células mais rapidamente, já que tudo está sendo reescrito com cada clone, em vez de algumas células aqui e ali.
Dito isto, existem muitas opções pagas disponíveis para fazer backup de dados, geralmente variando de US $ 20 a US $ 50. Pode valer a pena apenas pegar uma licença para uma delas.