Eu não conheço o gerenciador de janelas do i3, mas ele deve ter atalhos de teclado. Basta definir o início & mate atalhos para qualquer combinação de teclas que preferir.
Eu estou familiarizado com XFCE / XFWM que tem um GUI configurações de teclado, com um guia "atalhos de aplicativos", onde você pode definir qualquer comando terminal para praticamente qualquer combinação de teclas.
A partir de uma pesquisa na web para atalhos de teclado linux i3 , este hit ( link ) tem uma ponta isso deveria funcionar. Este exemplo executa gvim
quando os botões "Mod + F4" são pressionados:
bindsym $mod+F4 exec gvim