O Windows permite ocultar uma unidade do Explorer, mas não do gerenciamento de disco, para isso, vá para gerenciamento de computadores, gerenciamento de disco, clique com o botão direito do mouse na unidade e selecione "alterar letra e caminhos da unidade". Na próxima janela que aparece você deve ver a letra da unidade em destaque. Clique em remover e em OK. O disco agora deve estar oculto do explorador.
editado como @MichaelBay afirmou, porém, nenhuma letra de unidade será atribuída assim nenhuma letra de unidade para começar. A unidade só seria visível a partir do Gerenciamento do Computador.