De acordo com o RFC 3501, os elementos IMAP podem ter apenas um sinalizador para leitura (consulte aqui ). Então, sua abordagem pode não funcionar aqui.
Então, o que você precisa é de um software de terceiros. Fora do azul sem saber que você precisa do aplicativo opensource OTRS pode funcionar. OTRS pode buscar os emails de uma caixa de correio e os usuários podem trabalhar com eles. Os e-mails se tornarão tickets e sua maior clareza para o usuário entender quem procedeu com o e-mail e quais ainda estão abertos.