O uso da CPU apenas informa a ocupação da CPU. Ele não informa se alguns processos desejam mais tempo de CPU, mas não conseguem obtê-lo. Em ambientes Linux / UNIX, isso é medido usando a “média de carga”. Você não pode dizer se seu PC está sobrecarregado apenas olhando para o uso da CPU.
O processo de mineração provavelmente está sendo executado com prioridade muito baixa. Isso significa que ele terá menos tempo de CPU, pois processos com prioridade mais alta usam mais. No mesmo nível de prioridade, os processos têm peso igual. O agendamento é um assunto muito complexo.