Tente isto:
[Desktop Entry]
Name=My Custom Byobu
Comment=Custom Byobu Windows
Icon=byobu
Exec=BYOBU_WINDOWS=netbook-session byobu
Type=Application
Terminal=true
Categories=GNOME;GTK;Utility;
X-GNOME-Gettext-Domain=byobu
Isso é baseado no arquivo de área de trabalho byobu padrão em /usr/share/applications/byobu.desktop
.