Eu sugeriria tentar usar o programa photorec [1] tanto no cartão SD original quanto no disco rígido de 2TB para o qual você copiou os arquivos. Foi especificamente projetado para recuperar arquivos apagados em mídia removível. Não tenho certeza do que aconteceu com o ext2fsd, mas você pode tentar ver se o ext2fsd pode ver os arquivos se reconectar o HDD ao computador original. Note que pouquíssimas pessoas desenvolvem e usam o ext2fsd, então eu não posso falar com o quão bem ele funciona.
[1] link
A maioria dos usuários usará o Linux para ler o sistema de arquivos formatados com FAT / VFAT, e copiá-lo para um sistema de arquivos ext2 / 3/4, e não tentar usar o Windows para essa tarefa. Então, infelizmente, use o caminho menos percorrido, e corri para algum tipo de bug. : - (
Boa sorte!