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O Linux em poucas palavras é considerado um bom livro para os comandos do Linux. Você pode ver esse livro. (Eu admito que não li completamente o livro, mas me parece bom para comandos, veja abaixo o comentário de um leitor de verdade)
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Um diretório on-line de comandos úteis do Linux também pode ajudá-lo muito
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Eu encontrei o livro Bíblia Ubuntu Linux extremamente útil e uma introdução amigável ao Ubuntu. É de "William von Hagen".
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Você pode navegar nas páginas de manual do Linux em um navegador da Web instalando
man2html
.sudo apt-get install man2html
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Você pode navegar pelas páginas de informações do GNU digitando
info
após o nome do comando em um terminal. A Forma Gráfica para fazer o mesmo requerinfo2www
package. Instale-o comsudo apt-get install info2www
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(Estes são mais úteis, e eu recomendo strongmente que eles entendam os Comandos do Linux, como sed, grep e outros)