Isso parece suspeito como um disco rígido que está prestes a morrer.
Demora muito mais do que o normal para fazer a inicialização durante a inicialização, por isso ainda não está pronto quando o Bios faz sua rotina de detecção de disco rígido. (E como o Bios não o vê, ele não inicializa.)
Quando você conecta-o externamente, ele tem muito mais tempo para ser ligado, então quando seu sistema operacional alternativo tiver iniciado e começar a procurar discos adicionais (o Bios não é usado nesse caso), a unidade está finalmente " acordado "e utilizável.
Provavelmente, se você deixar a unidade dentro do laptop e inicializar o computador normalmente, ele não funcionará na primeira tentativa de inicialização, mas se você deixar o laptop em execução e reinicializar (sem desligar / desligar o laptop) ele poderá possível inicializar em uma segunda (ou terceira) tentativa.
Para verificar é realmente o disco e não um problema com o próprio laptop colocar outra unidade no laptop e ver se o Bios pode vê-lo. Se o laptop não reconhecer outro disco, o laptop está quebrado e provavelmente precisará de uma nova placa-mãe. (Nesse caso, espero que você ainda esteja na garantia. Esse é um reparo muito caro.)
Se o laptop pode ver o outro disco, o laptop em si é bom, mas seu disco rígido provavelmente está morrendo.
Como verificação adicional, você pode conectá-lo, como unidade externa, a outro computador e executar o CrystalDiskInfo ou outro utilitário que possa ler figuras SMART da unidade para analisar os dados SMART.
De qualquer forma: Obtenha seus arquivos importantes desse disco rígido o mais rápido possível enquanto ele ainda estiver funcionando como uma unidade externa! Pode ir de parcialmente morto a 100% de morte a qualquer momento. Eu recomendaria mesmo salvar seus arquivos PRIMEIRO e somente depois fazer qualquer outra experiência.