Você precisa executar o "Virtual Machine Connection" (vmconnect.exe) com direitos administrativos. Eu costumo ter este fixado na minha barra de tarefas do Windows com um atalho que automaticamente "Executar como administrador"
O motivo pelo qual ele funciona com o Hyper-V Manager sem isso é porque o snap-in do Hyper-V Manager quase sempre já é executado com direitos administrativos.