De acordo com este site, há uma ferramenta que permite personalizar os instaladores do Click 2013 para o Office 2013 e 2016:
Microsoft provides an official tool to customize Click-to-Run installer options so that you can force the installer to install your desired Office programs only.
This tool is called "Office Deployment Tool" and is available for Office 2013 and Office 2016 versions. With the help of this tool, you can download Office setup files at your desired location and then configure the installer to install your selected Office apps only.
O site contém etapas para corrigir o arquivo XML que é essencialmente um arquivo "não-assistido" que fornece as respostas para o instalador e permite que você personalize quais aplicativos e configurações o instalador executa.