O VLC oferece suporte a opções gerais de linha de comando e opções por MRL. Você pode encontrar detalhes sobre Ajuda da linha de comando do VLC Wiki :
Options-styles:
--option A global option that is set for the duration of the program.
:option An option that only applies to the stream directly before it and that overrides previous settings.
Acho que você está procurando por esse recurso.
Exemplo de uso:
vlc --loop --no-autoscale file1 :zoom=2 file2 file3