Se você quiser uma configuração correta do monitor, sugiro usar uma distribuição baseada no Ubuntu. Todas as outras distribuições nunca pareceram ter um bom suporte para vários monitores.
É claro que você pode instalar arandr
ou programas similares, mas pelo que sei eles não irão ajudá-lo no seu problema. E mesmo se o fizerem, provavelmente permanecerá até a próxima inicialização.