Eu quero usar os dois, mas eles usam o mesmo perfil. Eu queria fazer um para a Waterfox, mas percebi que o Firefox provavelmente vai mudar. E eu prefiro não executá-lo via parametros como perfil, já que eu quero lançar o Waterfox através da barra de tarefas (e que eu saiba que você não pode ter parâmetros lá, como você pode com atalhos regulares).
Para reformular minha pergunta, quero que eles sejam completamente separados, assim como o Chrome e o Firefox funcionariam lado a lado.
Obrigado.
Eu usaria as versões portáteis de ambos os navegadores, porque a pasta de perfil deles está na pasta principal, por isso é independente.
Mas você também pode copiar a pasta do perfil (\ user) de um para o outro e sincronizá-lo. Waterfox 55 compatível com Firefox55 mas também com versões mais antigas do Firefox