Basta desmarcar a caixa de seleção na frente de Criar uma unidade inicializável usando ... e selecionar o sistema de arquivos desejado. Em seguida, pressione Iniciar. É isso.
Explicação: O Rufus pode formatar muito uma unidade flash USB como normal (não inicializável). Você só tem que dizer isso por não verificar a opção inicializável.