Desculpe pelo título confuso, tentei entender, mas não funcionou.
Digamos que eu tenha uma pasta do windows chamada 'share' em ' C:/share ' e no linux eu tenho uma pasta em /var/www normalmente, se houver conteúdo em share mas não em /var/www eu faria mount -t vboxsf share /var/www e funciona, mas, neste caso, já existe conteúdo em /var/www e C:/share está vazio.
Se eu executasse o mesmo comando, a montagem funcionaria, mas tudo em / var / www desapareceria, minha pergunta é como montá-lo, mantendo o conteúdo em /var/www
O que você está tentando fazer não faz sentido no nível do sistema de arquivos. Você está pedindo ao Linux para mesclar o conteúdo dos diretórios em dois sistemas de arquivos em uma única visualização. Isso não funciona. Ex: como o Linux saberia onde escrever um novo arquivo?
Você disse que um estava vazio. Eu estou querendo saber, existe? Porque isso soa semelhante a um symlink em sistemas * nix. Eu fiz algo assim várias vezes no Virtual Box ... Eu estou supondo que há mais na história que você está contando, no entanto.