Você pode configurá-lo com o CompizConfig-Settings-Manager.
1) Instale isso: sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
,
2) Abra ccsm ( Alt + F2 e digite ccsm
e tecle Enter )
3) Vá para "Opções gerais" > "Foco e aumentar o comportamento" e defina "Focus Prevention Level" como "Off".
4) Aproveite ;-)
Se você estiver com preguiça, cole isso no terminal e pronto:
gconftool-2 --type=Integer --set /apps/compiz-1/general/screen0/options/focus_prevention_level 0